6月份是苹果树生长发育的关键时期，新梢生长、果实发育、花芽分化同步进行，营养生长和生殖生长对营养物质的积累、分配和消耗相互制约，也是麦收前后病虫害防治的关键时期。
一、苹果套袋
为了生产优质高档果品，最好使用质量稳定的高档双层纸袋。有条件的果园浇水后套袋更好。
套袋的时间因不同地区、不同苹果品种而不同。套袋过早，幼果太小，容易发生落果和日烧，加上果形判断不准，影响后期商品率。套袋过晚，果实皮孔易大，表面粗糙，苹果退绿不彻底，底色发绿，摘袋后上色慢，影响后期色泽。对于红色品种富士苹果套袋一般在生理落果（5月下旬）之后进行，即从落花后45天左右开始，2周内完成，大约为5月20日开始，最迟于6月下旬套完。因为6月落果已经结束，果实优劣表现明显，果柄木质化程度和果皮老化程度增高，不容易伤果实。套袋时，应选择晴好天气的上午8：30至下午17：00之间进行。早晨露水未干时不能套袋，否则容易形成水锈或在萼洼处产生黑色斑点。套袋应尽量避开温度最高的时段（气温30以上）和阳光直射的方位。要保证果袋撑圆，果实悬空，袋角透气孔张开，扎紧袋口。套袋前喷药既要杀菌又要杀虫，建议选用正规厂家出的悬浮剂，水剂，粉剂；尽量不用有机磷杀虫剂，不用乳油制剂。
二、肥水管理
随着树龄的增大、一些果园留果量过多以及管理不善等多种原因，许多果园树势偏弱，加之近年大小结果现象突出，六月追肥是花芽分化的关键时期，需尽快进行。目的是充实顶芽，提高明年花芽质量。
重视氮、磷、钾肥的配合使用。在其新梢停长后，推荐使用五合一肥王＋高磷植炼素（12-50-8），或根土一号＋根土一号5D高磷型（12-45-8）；对幼树应适当控水，结果树以不旱为宜，抑制新梢生长，积累养分，同时注意排水防涝，及时进行中耕除草，抑制杂草生长。
三、夏季修剪
本月份是花芽分化关键的时期，也是夏季修剪的重要时期，为确保当年形成足够的花量，达到稳产、高产的目的。夏剪的目的是调整树体结构、改善光照条件、均衡树体生长、促进营养生长向生殖生长转化。
要及时综合运用扭梢、摘心、拿枝、环切、拉枝、疏枝等夏剪措施，调节树体生长，缓势促花。对其竞争枝、直立枝、过旺枝有空间的要进行扭梢或极重短截，无空间的要疏除；对强旺幼树当延长梢长到40厘米左右要摘心，促发分枝，以加速树冠成形。
四、病虫害防治
此期病虫害主要有炭疽叶枯病、轮纹病、斑点落叶病、褐斑病，以及腐烂病和山楂叶螨、二斑叶螨、绣线菊蚜（黄蚜）、金纹细蛾、旋纹潜叶蛾、桃小食心虫等。
炭疽叶枯病：炭疽叶枯病可防但不好治，因为该病从侵染到发病落叶仅有2~3天，所以重在“防”，使其不发病。
有效预防好该病菌的侵染，需要在果树套袋后及时打两遍波尔多液进行防治。
轮纹病：此期病菌都已进入大量形成孢子的时期，若降雨或高湿，均有大量孢子散发出来侵染果实，导致果实带菌。降雨后及时喷药是减轻后期烂果的关键。
斑点落叶病：6月下旬，如果降雨较多，病梢嫩叶可能大量受病菌侵染。
褐斑病：越冬病菌花后即开始开始侵染叶片，6月中旬开始发病。该病多从树冠下部开始发生，逐渐向树冠中上部扩展蔓延。
山楂叶螨：进入6月，因气温升高，繁殖加快，前期发展较快的果园，6月中下旬能出现落叶现象。麦收前后要切实注意搞好防治。二斑叶螨：5月底到6月上旬开始上树危害，初期繁殖较慢，危害不重，但应早期注意防治，避免以后成灾。
绣线菊蚜（黄蚜）：麦收前，这种蚜虫危害较重。一个新梢上常常聚集成百上千头蚜虫危害，造成叶片卷缩、新梢瘦弱，对幼树及幼苗危害较重。
金纹细蛾（潜叶蛾）：5月下旬是金纹细蛾一代成虫发生高峰期。6月初，第三代幼虫蛀叶危害，幼虫蛀叶初期仍是药剂防治关键时期。
桃小食心虫：越冬幼虫5月下旬开始出土，6月中下旬为出土高峰期，幼虫出土和降雨关系密切。幼虫出土时施药防治效果较好，可在出土盛期用40%毒死蜱乳油300～400倍进行地面防治，树上防治可选喷菊酯类杀虫剂防治。建议使用：30%戊唑醇，代森锰锌，甲托，毒死蜱，哒螨灵。
腐烂病的防治：6～7月是果树落皮层形成期，是苹果树腐烂病防治的关键时期。一般来说，新梢停长以后，果树枝干转向加粗生长，落皮层形成。
防治上，在新梢停长后1～2周内，用普德金第一次涂干，间隔半个月，进行第二次涂干。
